广西大学学报(自科)

2020, v.45;No.178(06) 1498-1507

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基于TCGA研究铁死亡相关基因对乳腺癌患者的预后
Ferroptosis-related gene and its relationship with prognosis of breast cancer patients based on TCGA

侯晨阳;胡艳玲;黄代政;毛宇昂;

摘要(Abstract):

乳腺癌是起源于乳腺上皮组织的恶性肿瘤,是一种高度异质性的疾病,这使得研究其乳腺癌的预后具有挑战性。铁死亡是一种铁依赖性的,区别于细胞凋亡、细胞坏死、细胞自噬的新型的细胞程序性死亡方式。因此,铁死亡相关基因在乳腺癌中的预后价值的研究是有必要的。本研究从公共数据库下载了乳腺癌患者的mRNA表达谱及相应的临床资料。使用LASSO Cox回归在TCGA队列中构建多基因预后模型。来自MRTABRIC队列的乳腺癌患者被用于验证。结果显示,在TCGA队列中,大多数与铁死亡相关的基因(79.1%)在肿瘤和邻近正常组织之间差异表达。在单因素Cox回归分析中,20个差异表达基因与预后生存相关(P<0.05)。本研究构建了一个16个铁死亡相关基因的预后模型,将患者分成高、低风险两组人群,与低风险组相比,高风险组总体生存率明显降低(P<0.001)。在多因素Cox回归分析中,风险得分可以作为独立的预后因子(P<0.001)。此外,本研究根据预后模型,对患者数据进行高、低风险分组,求其风险差异。据差异表达基因进行GO分析、KEGG分析和ssGSEA分析,发现和免疫相关通路有关(P<0.05)。总之,16个铁死亡相关基因可以用于预测乳腺癌的预后,并有利于进一步指导临床治疗。

关键词(KeyWords): 乳腺癌;铁死亡;TCGA数据库;预后

Abstract:

Keywords:

基金项目(Foundation): 国家自然科学基金资助项目(81860604)

作者(Author): 侯晨阳;胡艳玲;黄代政;毛宇昂;

Email:

DOI: 10.13624/j.cnki.issn.1001-7445.2020.1498

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